MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4a

Total Repeats: 1266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011986	TCC	2	6	59634	59639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102391
1002	NC_011986	GAA	2	6	59641	59646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102391
1003	NC_011986	TGCT	2	8	59689	59696	0 %	50 %	25 %	25 %	222102391
1004	NC_011986	CT	3	6	59722	59727	0 %	50 %	0 %	50 %	222102391
1005	NC_011986	A	6	6	59740	59745	100 %	0 %	0 %	0 %	222102391
1006	NC_011986	TCCT	2	8	59757	59764	0 %	50 %	0 %	50 %	222102391
1007	NC_011986	CG	3	6	60029	60034	0 %	0 %	50 %	50 %	222102392
1008	NC_011986	GGT	2	6	60083	60088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102392
1009	NC_011986	CCA	2	6	60101	60106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102392
1010	NC_011986	CGC	2	6	60257	60262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102392
1011	NC_011986	GAC	2	6	60320	60325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102392
1012	NC_011986	GAA	2	6	60410	60415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102392
1013	NC_011986	GAT	2	6	60733	60738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102393
1014	NC_011986	CGCC	2	8	60796	60803	0 %	0 %	25 %	75 %	222102393
1015	NC_011986	CGC	2	6	60814	60819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102393
1016	NC_011986	GCATC	2	10	60918	60927	20 %	20 %	20 %	40 %	222102393
1017	NC_011986	ATT	2	6	60980	60985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102393
1018	NC_011986	GTG	2	6	61034	61039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102393
1019	NC_011986	AGA	2	6	61057	61062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102393
1020	NC_011986	GGC	2	6	61066	61071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102393
1021	NC_011986	CAC	2	6	61117	61122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102393
1022	NC_011986	CGC	2	6	61142	61147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102393
1023	NC_011986	GCA	2	6	61150	61155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102393
1024	NC_011986	GC	3	6	61163	61168	0 %	0 %	50 %	50 %	222102393
1025	NC_011986	GAA	2	6	61180	61185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102393
1026	NC_011986	GCG	2	6	61188	61193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102393
1027	NC_011986	GGA	2	6	61201	61206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102393
1028	NC_011986	GAT	2	6	61267	61272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102393
1029	NC_011986	CGA	2	6	61288	61293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102393
1030	NC_011986	CGC	2	6	61301	61306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102393
1031	NC_011986	GCG	2	6	61413	61418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102393
1032	NC_011986	AAC	2	6	61913	61918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102394
1033	NC_011986	TGG	2	6	61946	61951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102394
1034	NC_011986	GGA	2	6	61982	61987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102394
1035	NC_011986	CGA	2	6	61997	62002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102394
1036	NC_011986	CGC	2	6	62037	62042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102394
1037	NC_011986	TCCG	2	8	62063	62070	0 %	25 %	25 %	50 %	222102394
1038	NC_011986	CGA	2	6	62408	62413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102395
1039	NC_011986	GACG	2	8	62417	62424	25 %	0 %	50 %	25 %	222102395
1040	NC_011986	GC	3	6	62428	62433	0 %	0 %	50 %	50 %	222102395
1041	NC_011986	ATG	2	6	62527	62532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102395
1042	NC_011986	TCA	2	6	62533	62538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102395
1043	NC_011986	AAGG	2	8	62550	62557	50 %	0 %	50 %	0 %	222102395
1044	NC_011986	GACGCC	2	12	62561	62572	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222102395
1045	NC_011986	TC	3	6	63647	63652	0 %	50 %	0 %	50 %	222102396
1046	NC_011986	GAC	2	6	63778	63783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102397
1047	NC_011986	TTC	2	6	63955	63960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102397
1048	NC_011986	CAG	2	6	64027	64032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102397
1049	NC_011986	GAG	2	6	64524	64529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102398
1050	NC_011986	GCTTCT	2	12	64651	64662	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	222102398
1051	NC_011986	TCA	2	6	64667	64672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102398
1052	NC_011986	CGT	2	6	64676	64681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102398
1053	NC_011986	ATCA	2	8	64728	64735	50 %	25 %	0 %	25 %	222102398
1054	NC_011986	CTC	2	6	64737	64742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102398
1055	NC_011986	TGCG	2	8	64783	64790	0 %	25 %	50 %	25 %	222102398
1056	NC_011986	GAC	2	6	64816	64821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102398
1057	NC_011986	GAA	2	6	64952	64957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102399
1058	NC_011986	AGAT	2	8	65110	65117	50 %	25 %	25 %	0 %	222102399
1059	NC_011986	CGA	2	6	65239	65244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102399
1060	NC_011986	GCG	2	6	65382	65387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102399
1061	NC_011986	TCC	2	6	65620	65625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102399
1062	NC_011986	GCT	2	6	65834	65839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102399
1063	NC_011986	CTG	2	6	65967	65972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102399
1064	NC_011986	TCC	2	6	65989	65994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102399
1065	NC_011986	TCC	2	6	66001	66006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102399
1066	NC_011986	CA	3	6	66032	66037	50 %	0 %	0 %	50 %	222102399
1067	NC_011986	CAC	2	6	66110	66115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102399
1068	NC_011986	CCTCG	2	10	66161	66170	0 %	20 %	20 %	60 %	222102399
1069	NC_011986	CAG	2	6	66275	66280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102399
1070	NC_011986	TGG	2	6	66286	66291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102399
1071	NC_011986	GGT	2	6	66371	66376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102399
1072	NC_011986	TCC	2	6	66433	66438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102399
1073	NC_011986	GC	3	6	66497	66502	0 %	0 %	50 %	50 %	222102399
1074	NC_011986	GCG	2	6	66558	66563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102400
1075	NC_011986	CG	3	6	66562	66567	0 %	0 %	50 %	50 %	222102400
1076	NC_011986	GTG	2	6	66572	66577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102400
1077	NC_011986	AAG	2	6	66586	66591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102400
1078	NC_011986	GAA	2	6	66655	66660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102400
1079	NC_011986	TTC	2	6	66700	66705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102400
1080	NC_011986	GAAA	2	8	66736	66743	75 %	0 %	25 %	0 %	222102400
1081	NC_011986	GACG	2	8	66777	66784	25 %	0 %	50 %	25 %	222102400
1082	NC_011986	CCA	2	6	66855	66860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102400
1083	NC_011986	TGGC	2	8	67059	67066	0 %	25 %	50 %	25 %	222102400
1084	NC_011986	CCG	2	6	67151	67156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102400
1085	NC_011986	GC	3	6	67215	67220	0 %	0 %	50 %	50 %	222102400
1086	NC_011986	GAC	2	6	67264	67269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102400
1087	NC_011986	CGTG	2	8	67276	67283	0 %	25 %	50 %	25 %	222102400
1088	NC_011986	GAACT	2	10	67441	67450	40 %	20 %	20 %	20 %	222102400
1089	NC_011986	ATT	2	6	67457	67462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102400
1090	NC_011986	ACC	2	6	67989	67994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102401
1091	NC_011986	AGG	2	6	67996	68001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102401
1092	NC_011986	TCA	2	6	68062	68067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102401
1093	NC_011986	CAT	2	6	68120	68125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102401
1094	NC_011986	CTC	2	6	68133	68138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102401
1095	NC_011986	CAA	2	6	68192	68197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102401
1096	NC_011986	CCGGT	2	10	68263	68272	0 %	20 %	40 %	40 %	222102401
1097	NC_011986	GCC	2	6	68283	68288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102401
1098	NC_011986	GT	3	6	68306	68311	0 %	50 %	50 %	0 %	222102401
1099	NC_011986	TCG	2	6	69668	69673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102402
1100	NC_011986	CGG	2	6	69707	69712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102402
1101	NC_011986	TGC	2	6	69726	69731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102402
1102	NC_011986	TGC	2	6	69737	69742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102402
1103	NC_011986	CCG	2	6	69797	69802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102402
1104	NC_011986	GGA	2	6	69843	69848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102402
1105	NC_011986	TGC	2	6	69918	69923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102402
1106	NC_011986	ATC	2	6	69943	69948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102402
1107	NC_011986	CGC	2	6	69952	69957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102402
1108	NC_011986	ACG	2	6	70007	70012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102402
1109	NC_011986	AGC	2	6	70025	70030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102402
1110	NC_011986	GAT	2	6	70051	70056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102402
1111	NC_011986	TC	3	6	70084	70089	0 %	50 %	0 %	50 %	222102402
1112	NC_011986	TGA	2	6	70130	70135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102402
1113	NC_011986	CGG	2	6	70176	70181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102402
1114	NC_011986	CAGG	2	8	70198	70205	25 %	0 %	50 %	25 %	222102402
1115	NC_011986	GCG	2	6	70241	70246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102402
1116	NC_011986	ACAT	2	8	70345	70352	50 %	25 %	0 %	25 %	222102402
1117	NC_011986	TGA	2	6	70416	70421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102402
1118	NC_011986	CGA	2	6	70569	70574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102402
1119	NC_011986	GGT	2	6	70593	70598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102402
1120	NC_011986	TAC	2	6	70612	70617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102402
1121	NC_011986	TGA	2	6	70656	70661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102402
1122	NC_011986	GGA	2	6	70686	70691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102402
1123	NC_011986	GAC	2	6	70693	70698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102402
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1125	NC_011986	CTG	2	6	70757	70762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102402
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1250	NC_011986	CAT	2	6	77911	77916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102411
1251	NC_011986	AGC	2	6	77919	77924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102411
1252	NC_011986	CCG	2	6	77971	77976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102411
1253	NC_011986	TCA	2	6	78027	78032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102411
1254	NC_011986	CCAG	2	8	78045	78052	25 %	0 %	25 %	50 %	222102411
1255	NC_011986	ACG	2	6	78063	78068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102411
1256	NC_011986	TCG	2	6	78141	78146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102411
1257	NC_011986	CGA	2	6	78184	78189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102411
1258	NC_011986	CTC	2	6	78302	78307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102411
1259	NC_011986	CGG	2	6	78355	78360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102411
1260	NC_011986	CGA	2	6	78388	78393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102411
1261	NC_011986	CG	3	6	78406	78411	0 %	0 %	50 %	50 %	222102411
1262	NC_011986	CCGG	2	8	78507	78514	0 %	0 %	50 %	50 %	222102411
1263	NC_011986	AGA	2	6	78538	78543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102411
1264	NC_011986	CGG	2	6	78561	78566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102411
1265	NC_011986	GCTG	2	8	78633	78640	0 %	25 %	50 %	25 %	222102411
1266	NC_011986	GCC	3	9	78677	78685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102411

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